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OUI au VACCIN !!
Author : Hubert33 
9/155

Date :    18-10-2021 19:55:57


Souche signifie le virus historique et toute la descendance
Le virus historique est répertorié comme 19A, bien qu'il ait été séquencé en janvier 2020. Le premier variant est 19B. Ensuite, 20A avec la D614G sur Spike mais ne pas oublier la P324L sur nsp12 (RdRp) et le 20B avec deux mutations sur N (203 et 204)
Author : Zorbeclegras 
10/155

Date :    18-10-2021 20:12:39


Je maintiens ce que je dis, dans un congrès de virologie personne ne te lapidera si tu dis "souche" et pas "isolat".
Tu n'es pas obligé de suivre l'avis des plus tâtillons des virologues. Comme je l'ai écrit plus haut, les termes souche, variant et lignée sont, d'après l'avis du CDC, interchangeables. L'essentiel est que l'on se comprenne.
Author : Hubert33 
11/155

Date :    18-10-2021 20:23:04


Nous sommes d'accord, peu importe les termes et notions, l'essentiel est de savoir de quoi l'on parle, ce qui permet ensuite de se comprendre.
J'ai signé la missive adressée aux Députés contre la prorogation du passe et de l'état d'urgence. Sonigo est de la partie.
Author : Hubert33 
12/155

Date :    18-10-2021 21:09:50


Une épidémie de syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus 2 causée par la variante Gamma préoccupante a infecté 24/44 (55%) employés d'une mine d'or en Guyane française (87% symptomatique, pas de formes sévères). Le taux d'attaque était de 60 % (15/25) chez les mineurs complètement vaccinés et de 75 % (3/4) chez les mineurs non vaccinés sans antécédent d'infection.

https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/27/10/21-1427_article
Author : Prigogine  
13/155

Date :    18-10-2021 21:30:39


@Hubert33 : Pardon d’insister mais il en va bien plus que d’une histoire de terminologie tatillonne ! Il existe bien une définition précise au sein de la communauté virologique en ce qui concerne la différence entre un variant et un mutant ! Cette distinction n’est pas interchangeable, je puis vous l’assurer !
Confondre variant et mutant souligne la méconnaissance des stratégies de réplication des virus. Un variant n’a rien à voir avec un mutant et inversement ! Ce n’est par hasard que l’on parle re variant pour les coronavirus et de mutant pour certains virus grippaux.
Les coronavirus possèdent un complexe réplicatif possédant une activité RNAse H leur permettant de corriger les erreurs de recopiage du génome lors de leur réplication, ils mutent donc peu !
Par contre leur variabilité génétique provient de ce que l’on appelle des mécanismes de recombinaison (attention ce n’est pas du réassortiment des virus à génomes segmentés) et génère ce que l’on appelle des variants en virologie.
Confondre variant et mutant témoigne donc de lacunes dans la maitrise des stratégies réplicatives des virus. Contrairement à ce qui est faussement affirmé le terme variant n’est pas une terminologie épidémiologique mais bien virologique, car elle décrit un mécanisme de variabilité génétique par recombinaison ! Je suis atterré par certaines affirmations des plus légères et totalement inexactes. Et non dans un Congré de Virologie on ne fait pas la confusion entre ces 2 termes !
Pour le reste je pense que tu devrais te relire car comme précisé précédemment, tu as à plusieurs reprises confondu mutants et variants, et drift avec réassortiment. Je ne parlerai donc pas de shift afin de ne pas susciter trop de frustration dans les subtilités réplicatives des virus grippaux.
Les émergences virales sont le résultat de mutations, de recombinaisons ou de réassortiments en fonction de la nature du génome viral et de sa stratégie réplicative. C’est ce qui rend la virologie moléculaire passionnante.
Author : Prigogine  
14/155

Date :    18-10-2021 21:36:15


Concernant le virus de 1918, je ne suis pas certain que tu me lises toujours très bien !
Pourtant l’auteur de ce meta article précise le faisceau d’arguments en faveur d’une origine aviaire, tout en balayant les autres hypothèses. L’hypothèse du glissement antigénique d’une souche aviaire provient du séquençage du gène de l’hémagglutinine d’une souche isolée depuis des cadavres inuits et congelés depuis 1918.
Author : Hubert33 
15/155

Date :    19-10-2021 10:25:13


@Prigogine
Non, je n'ai pas confondu mutant et variant, j'ai même précisé la différence. Un mutant désigne une altération dans le génome, certaines mutations pouvant être neutres ou silencieuses. Un variant est un mutant qui a réussi, pour le savoir, il faut observer l'épidémie, c'est le seul moyen pour le savoir. Pour le virus de 1918, je n'ai pas nié l'origine aviaire, j'ai juste dit que pour quelques virologues, l'origine par un drift n'est pas certaine, un réassortiment est plausible.

Sinon, l'Assemblée se penche sur la prorogation du passe sanitaire, qu'en penses-tu, pour ou contre ?
Author : Prigogine  
16/155

Date :    19-10-2021 14:32:45


@Hubert33 : L’avantage de ce forum, c’est que l’on peut assister à des déambulations oratoires de personnes peu scrupuleuses de la légèreté de leurs affirmations, mais véhiculant des inexactitudes voire des erreurs.
Un variant viral n’est absolument pas ce qui est avancé. Un peu de logique virale permettra de comprendre que la motivation de la Communauté virologique à poser le concept de variant vient de sa racine qui nous rappelle que les virus passent leur temps … à varier. La mutation ponctuelle est un mécanisme de variation résultant de la fiabilité perfectible des polymérases virale dans leur propension évolutionniste à réaliser des erreurs de lecture et donc de recopiage du génome viral. (Sauf pour les coronavirus !)
Certes elle peut même être neutre ou silencieuse, mais il n’y a là rien de très curieux à la lueur de la dégénérescence du code génétique qui permet à un même triplet de codons de coder pour plusieurs acides aminés, ou pour plusieurs triplets différents de coder pour le même acide aminé. Bref rien de très surprenant en ce monde de la biologie moléculaire, bien au contraire.
Par contre la variance des génomes viraux peut également provenir de mécanismes dits de recombinaison ou de réassortiments, et qui se traduisent par des variations génétiques qui ne sont plus ponctuelles mais concernent des fragments plus conséquents du génome viral (insertion, délétions …). On a donc rajouté ce terme de variant afin de le distinguer du simple mutant, car il y a là la manifestation de mécanismes réplicatifs à l’origine de variations génomiques très différentes.
Contrairement à ce qui est affirmé, un variant n’est pas un mutant qui a réussi ! Cette affirmation révèle encore une fois une méconnaissance de la virologie moléculaire et véhicule des représentations erronées et contreproductive dans la tentative d’élaboration d’avis éclairé par les … 2 lecteurs de ce forum ! Hé hé hé !

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